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5大科室,,500+醫(yī)生的病原微生物檢測技術(shù)應用調(diào)研結(jié)果

所屬地區(qū):上海 - 上海 發(fā)布日期:2025-01-31
所屬地區(qū):上海 - 上海 招標業(yè)主:登錄查看 信息類型:中標公告
更新時間:2025/01/31 招標代理:登錄查看 截止時間:登錄查看
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有觀點,,有態(tài)度
這是醫(yī)業(yè)觀察的第2400-4期文章
來源:丁香園檢驗時間
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感染性疾病起病急、進展快,,早期精準識別和監(jiān)測病原體耐藥性對患者預后及遏制耐藥至關(guān)重要[1],。在快速診療需求日益增多的情況下,快速檢測技術(shù)逐漸成為檢驗和臨床關(guān)注的焦點[1],。為深入了解當前病原微生物檢測技術(shù)的應用現(xiàn)狀,,一項專項調(diào)研面向檢驗科、血液科,、呼吸科,、感染科,、重癥監(jiān)護室等5大科室開展,通過多維度收集與分析最近一個月的實際應用情況,,展示病原微生物檢測免疫及分子技術(shù)應用中的差異和趨勢,,為病原菌檢測的新技術(shù)應用提供參考。
自2024年11月5日起,,截至2024年11月25日,,共發(fā)放調(diào)研問卷總數(shù)505份,完成調(diào)研合格問卷達458份(91%),,本次覆蓋24個省份,、119(略)、213家醫(yī)院,,并根(略)的級別分為核(略),、其(略)。本次調(diào)研要點梳理如下,,供讀者參考,。
主要調(diào)研問卷結(jié)果速覽
1、不同快速檢測技術(shù)可及率有差異,,各科室分子檢測技術(shù)可及率普遍較高
整體方面看,,核(略),也呈現(xiàn)相同的特點,,特別是tNGS,、mNGS,可及率基本都排在前三位(圖2),。
圖1.核(略),、其(略)病原微生物檢測技術(shù)總體反饋的可及率
圖2.核(略)反饋的可及率
2、除院內(nèi)檢驗科開展的檢測項目之外,,臨床科室可以送檢更多的檢測方法,,其中,mNGS技術(shù)送檢率占比最高
在免疫及分子的檢測中,,檢驗科開展GM/G試驗比例最高,,達14%,其次依次為PCR技術(shù)(占8%),、膠體金Carba-5(5%),,tNGS和mNGS占比最低,均為3%(圖3),。臨床科室分子檢測送檢率更高,其中,,呼吸內(nèi)科tNGS送檢率最高,,血液科,、感染科及重癥監(jiān)護室均以mNGS送檢率最高。
圖3.最近一個月檢驗科不同檢測技術(shù)開展率及臨床科室不同檢測技術(shù)送檢率
值得一提的是,,整體來看,,病原菌采用分子檢測的早期送檢率達16%(未除重),較估算的2024年初的10%有明顯的增長趨勢,。
附:
(略)以mNGS(27%)和GM/G(32%)試驗為主(圖4),。
圖4.最近一個月核(略)不同檢測技術(shù)送檢率
(略)則以GM/G(28%)試驗、tNGS(20%)和mNGS(19%)為主(圖5),。
圖5.最近一個月其(略)不同檢測技術(shù)送檢率
3,、臨床科室送檢樣本病原菌檢出率均在70%以上,感染類型占比細菌>病毒>真菌
總體上,,臨床各科室送檢樣本病原菌檢出率≥70%,,其中重癥監(jiān)護室送檢樣本檢出率最高,達95%,,其次依次為血液科(85%),、呼吸內(nèi)科(73%),感染科(70%),。
臨床科室感染類型中,,細菌感染占比最高,達37%,。各科室間感染類型存在差異,,血液科與呼吸科感染類型與總體特征保持一致,感染科細菌和病毒感染水平一致,,真菌感染比例最低,。重癥監(jiān)護室細菌感染占比最高(51%)(圖6)。
圖6.最近一個月臨床科室送檢樣本病原菌檢出率及各科室感染類型占比
附:
(略)送檢樣本感染率最高,,高達95%(圖7,、圖8)。
圖7.最近一個月核(略)感染類型占比
圖8.最近一個月其(略)感染類型占比
(略)以細菌感染為主,。不過核(略)病毒感染(29%)遠高于其(略)病毒感染病例(13%),。核(略)呼吸內(nèi)科及感染科以細菌和病毒感染為主。而其(略)僅感染科以細菌(30%)和病毒(28%)感染為主(圖8),。
4,、不同檢測技術(shù)送檢標本類型和占比略有差異
485份問卷中,tNGS檢驗問卷184份,,mNGS檢驗問卷250份,,PCR檢驗問卷129份,GM/G檢驗問卷260份,tNGS檢驗問卷184份,,膠體金Carba-5檢驗問卷64份,。最近一個月內(nèi):
4.1分子檢測技術(shù)(mNGS、tNGS,、PCR)送檢標本類型更多樣,,肺泡灌洗液BALF、痰培養(yǎng)標本,、血液,、體液(如腦脊液,胸腔積液)送檢率均在30%以上,,尤以肺泡灌洗液BALF占比最高,,均在80%以上。PCR檢測技術(shù)應用中以熒光定量PCR為主(78%),,其次為傳統(tǒng)PCR(21%)和數(shù)字PCR(17%),。分子檢測中,疾病類型以呼吸道感染和肺部感染為主,;
4.2GM/G試驗中送檢標本以血液(92%)和肺泡灌洗液BALF(60%)為主,,疾病類型以呼吸道感染、肺部感染為主,;
4.3膠體金Carba-5送檢標本以血液(61%),、痰培養(yǎng)標本(56%)、肺泡灌洗液BALF(55%)為主,,疾病類型以肺部感染為主,。
附:
最近一個月內(nèi):
(略)分子檢測技術(shù)(mNGS、tNGS,、PCR)送檢標本構(gòu)成和其(略)分子檢測技術(shù)(mNGS,、tNGS、PCR)送檢標本構(gòu)成均與總體結(jié)果相似,,肺泡灌洗液BALF,、痰培養(yǎng)標本、血液送檢率均在30%以上,,尤以肺泡灌洗液BALF占比最高,,核(略)在80%以上,其(略)在90%以上,;tNGS和PCR檢測疾病感染類型以呼吸道感染為主,,mNGS疾病感染類型以肺部感染為主;
(略)GM/G試驗中送檢標本以血液(93%)和肺泡灌洗液BALF(59%)為主,,和其(略)基本一致:GM/G試驗中送檢標本以血液(92%)和肺泡灌洗液BALF(62%)為主,,疾病感染類型以肺部感染為主,;
(略)膠體金Carba-5送檢標本以血液(60%)、痰培養(yǎng)標本(60%),、肺泡灌洗液BALF(56%)為主,,疾病類型均以肺部感染為主。其(略)略有不同:膠體金Carba-5送檢標本以血液(63%),、肺泡灌洗液BALF(50%)、痰培養(yǎng)標本(44%)為主,,疾病類型均以細菌感染為主,。
5、懷疑真菌感染時,,醫(yī)生認為應該選擇4~5種檢測手段聯(lián)合檢測
當懷疑真菌感染時,,總體上醫(yī)生認為應該選擇4種(34%)或5種(28%)不同的方式:(略)
附:
(略)選擇聯(lián)合檢測特征均相似。核(略):聯(lián)合檢測方式:(略)
6,、臨床科室啟動抗真菌診斷驅(qū)動治療的時機和標準基本一致
臨床科室啟動抗真菌診斷驅(qū)動治療的時機與標準基本一致,,影像學特征性表現(xiàn)(91%)、病原學陽性(88%),、G/GM試驗陽性(82%),、臨床癥狀(81%)是主要參考依據(jù)。存在4種情況啟動抗真菌診斷驅(qū)動治療占比最高,,達46%,,其次為存在3種情況(21%)和存在5種情況(19%)。
附:
(略)啟動抗真菌診斷驅(qū)動治療的時機與標準基本一致,。核(略)影像學特征性表現(xiàn)(90%),、病原學陽性(88%)、G/GM試驗陽性(81%),、臨床癥狀(81%)是主要參考依據(jù)(圖9),。存在4種情況啟動抗真菌診斷驅(qū)動治療占比最高,達46%,,其次為存在3種情況(22%)和存在5種情況(17%),。
圖9.核(略)啟動抗真菌診斷驅(qū)動治療的標準
(略)與核(略)特點基本一致:影像學特征性表現(xiàn)(91%)、病原學陽性(87%),、G/GM試驗陽性(84%),、臨床癥狀(81%)是主要參考依據(jù)(圖10)。存在4種情況啟動抗真菌診斷驅(qū)動治療占比最高,,達45%,,其次為存在5種情況(21%)和存在3種情況(19%)。
圖10.其(略)啟動抗真菌診斷驅(qū)動治療的標準
快速病原菌檢測技術(shù)在感染性疾病中的應用進展和價值
病原微生物檢測在診治感染性疾病中意義重大,,越來越多的檢測技術(shù)進入臨床工作中,,除了傳統(tǒng)的呼吸道病原檢測方法包括涂片染色鏡檢法,、微生物培養(yǎng)法、免疫學方法等[2],,還有以分子生物學為核心的實驗診斷技術(shù)包括PCR技術(shù),、基因測序技術(shù)外、溫擴增技術(shù)及分子雜交技術(shù)等[3],。每種檢測方法各具其優(yōu)勢和不足,,臨床醫(yī)生應根據(jù)患者疾病病情、免疫狀況及影像學表現(xiàn),,選擇適當?shù)臋z測方法,,必要時聯(lián)合多種檢測手段進行相互驗證,以便做出符合患者病情的正確診斷[2],。
本次調(diào)研中,,5大科室分子檢測技術(shù)使用率均較高,已成為臨床常用的聯(lián)合檢測方案之一,。
PCR技術(shù):1985年建立的體外特異性擴增一段特定核酸序列的技術(shù),,是目前病原微生物分子生物學檢測中應用最為廣泛的技術(shù)。第一代普通PCR技術(shù)只能定性,,不能準確定量,。1996年研究者們在常規(guī)PCR基礎上建立了實時PCR技術(shù)或熒光定量技術(shù),實現(xiàn)對PCR過程中產(chǎn)物量的實時監(jiān)測,,降低污染風險,,實現(xiàn)準確定量。數(shù)字PCR技術(shù)是基于傳統(tǒng)PCR技術(shù)及實時定量PCR發(fā)展起來的第3代技術(shù),,有助于對起始樣品進行絕對定量[3]
基因測序技術(shù):可用于全面鑒定各類病原微生物的種類以及具體分型,、流行病學溯源方面,可助力臨床快速診斷,。高通量測序技術(shù)為臨床感染性疾病提供了高通量檢測技術(shù)手段,,主要包括mNGS、tNGS和全基因組測序,。tNGS和mNGS通量高,,可一次性檢測百種以上病原,兩者差異在于mNGS為鳥槍法測序,,無需預設待檢病原,,但易受人源背景干擾。而tNGS通過特異性引物擴增或者雜交捕獲的方式:(略)
等溫擴增技術(shù):近年來等溫擴增技術(shù)發(fā)展迅速,,因不需要熱循環(huán)儀支持,,可以在更短的時間內(nèi)以恒定溫度實現(xiàn)目標基因快速高效擴增的特點,使其成為核酸擴增領域一種極有前途的替代方法[3],。
核酸分子雜交技術(shù):由于其靈敏度高,、特異性強,,在針對特定基因序列的定性和定量檢測等方面具有獨特優(yōu)勢。近年來,,隨著生物芯片和生物傳感技術(shù)的迅猛發(fā)展,,核酸分子雜交技術(shù)在感染性疾病的臨床分子診斷中也得到了廣泛應用[3]。
綜上所述,,先進分子診斷技術(shù)的發(fā)展和逐漸推廣臨床應用,,有助于感染性疾病的臨床診療邁入快速、便捷和精準的時代,,為感染性疾病的早期診斷,、治療監(jiān)測和預后隨訪提供了可靠的依據(jù)[2]。
備注:核(略)主要是以A(略)為主,,其(略)主要是以B類城為主。
·城市l(wèi)ist·
A(略)
(略),、(略),、(略)(略),、(略),、(略)(略),、(略),、(略)(略),、石(略),、(略)(略),、(略),、(略)(略),、(略),、烏魯(略)(略).......
B(略)
(略),、(略),、(略)(略),、(略),、(略)(略),、(略),、(略),、(略)(略),、(略),、(略)(略),、(略),、(略)(略),、(略),、(略)(略).......
(以(略)根據(jù)調(diào)研受訪人數(shù)排序)
?僅供醫(yī)療衛(wèi)生專業(yè)人士參考/閱讀
內(nèi)容策劃:楊茲
內(nèi)容審核:李陽
題圖來源:圖蟲創(chuàng)意
參考文獻:
[1].寧雅婷,楊啟文,陳新飛,等.臨床微生物快速檢測新技術(shù)發(fā)展現(xiàn)狀與前景[J].協(xié)和醫(yī)學雜志,2021,12(4):427-432.
[2].張玉林,曹彬.呼吸道感染的病原學檢測及其臨床應用[J].中華結(jié)核和呼吸雜志,2024,47(5):497-500
[3].應斌武.分子診斷技術(shù)檢測感染性疾病的應用和發(fā)展[J].中華檢驗醫(yī)學雜志,2022,45(3):207-213.
[4].中國醫(yī)療保健國際交流促進會臨床微生物學分會.靶向高通量測序在感染性疾病中應用與實踐專家共識[J].中華醫(yī)學雜志,2024,104(48):(略).
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