為了便于供應(yīng)商及時了解JD采購信息,，根據(jù)《JD物資服務(wù)集中采購需求管理暫行辦法》等有關(guān)規(guī)定,，現(xiàn)將“化合物庫”及“病原微生物靶點及藥物信息庫”網(wǎng)站采購意向公開如下：
（略）
采購項目名稱：（略）
需求概況
初步技術(shù)
參數(shù)
預(yù)算金額
（萬元）
預(yù)計采購時間
備注
1
化合物庫
為快速發(fā)現(xiàn)高效針對病毒靶點的小分子化合物,。采購內(nèi)容：《藥物篩選軟件》一套,；《藥物功能重定位庫》一套
1,、藥物篩選軟件
多種分子構(gòu)建功能：支持各種類型分子的構(gòu)建,，涵蓋小分子,、大分子和復(fù)合物等多種應(yīng)用場景,。
分子構(gòu)象搜索：支持多種分子構(gòu)象搜索方法，特別針對飽和環(huán)的構(gòu)象搜索優(yōu)化,。
蛋白同源模建：支持多模板融合建模和誘導(dǎo)契合建模,，并能夠進(jìn)行蛋白，抗體等多聚體建模,。
蛋白結(jié)構(gòu)分析：能夠分析蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)中的幾何參數(shù)（如鍵長,、鍵角、二面角）及內(nèi)部殘基相互作用,。
★藥效團(tuán)建模：提供基于配體,、復(fù)合物和受體的藥效團(tuán)建模功能。
★結(jié)合口袋預(yù)測：支持預(yù)測orthosteric（內(nèi)源性）及allosteric（變構(gòu)）口袋,。
★電子軌道演示：針對小分子,，能提供其電子軌道的3D演示。大蛋白也可以,，只是需要更強(qiáng)的計算設(shè)備,。
★分子對接：支持蛋白-小分子共價對接、蛋白-蛋白對接，并提供第三方對接工具的接口拓展,。
氨基酸貢獻(xiàn)分解：利用最新的算法,，基于分子對接的結(jié)果進(jìn)行蛋白質(zhì)氨基酸能量貢獻(xiàn)的分解，這樣可以針對氨基酸進(jìn)行小分子/大蛋白設(shè)計,。
★抗體-抗原等大蛋白PPI對接表面分析：能基于蛋白-蛋白對接表面進(jìn)行分析及篩選重要氨基酸,，進(jìn)行人源化設(shè)計，單點突變及序列改造,。
★分子/蛋白可視化與交互：可在手機(jī)/HoloLens等設(shè)備可視化展示分子結(jié)構(gòu),，包括原子、鍵合物,、鏈條,、殘基等多種分子元素。支持分子模型的旋轉(zhuǎn),、縮放和平移操作,，支持觸控和語音指令交互。提供藥物點和口袋點的可視化展示,，包括藥物組合和口袋組合的批量渲染,。
可視化設(shè)備支持：支持普通顯示器或投影儀展示3D分子結(jié)構(gòu)及相互作用，兼容多種輸入設(shè)備,。
（略）任務(wù)：支持從用戶動設(shè)備（如手機(jī)）/穿戴式設(shè)備（如HoloLens）提交任務(wù),，到用戶指定的匹配服務(wù)器上進(jìn)行運行，運行后結(jié)果返回用戶設(shè)備進(jìn)行三維演示,。
基于結(jié)構(gòu)的藥物設(shè)計：提供交互式分子設(shè)計和優(yōu)化功能,，結(jié)合自由能、應(yīng)力能和物化參數(shù),，設(shè)計高活性和生物利用度的分子,。
模塊化設(shè)計：集成FPocket和Pharmit模塊，用于蛋白-配體相互作用分析和口袋點檢測,。支持C#開發(fā)的多線程任務(wù)管理和外部模塊封裝,，能夠擴(kuò)展IDock模塊進(jìn)行對接計算。內(nèi)置CurvedUI,、Magic等第三方插件,，支持復(fù)雜粒子效果和虛擬操縱桿操作。
第三方軟件接口：支持與多種第三方軟件的無縫對接,，增強(qiáng)工作流程的靈活性,。
GPU加速：支持GPU加速，提升計算效率,。
穿戴式設(shè)備（如HoloLens）或移動設(shè)備（如手機(jī)）場景管理與持久化：內(nèi)置場景錨點管理器,，支持場景的自動記錄與重定位,，跨環(huán)境實現(xiàn)場景持久化渲染。
豐富的用戶界面組件：支持基于GIF和曲線UI的互動操作,。支持登錄,、口袋檢測、對接操作和QR碼掃描等UI面板的互動功能,。
（略）支持：支持Windows,、HoloLens、PC,、iOS和Android平臺的發(fā)布和運行,。
擴(kuò)展性：后臺語言公開，支持C#模塊的定制開發(fā),，便于用戶進(jìn)行二次開發(fā),。
用戶組件/模塊更新：用戶可以選擇跟新新的模塊及功能。（略）項目的導(dǎo)入和導(dǎo)出,，方便應(yīng)用程序的分發(fā),。
2、藥物功能重定位庫
2.1不少于5200種全（略）藥物和臨床藥物,，可用于高通量篩選和高內(nèi)涵篩選,，以及老藥新用、新的藥物靶點篩選和細(xì)胞誘導(dǎo)等研究方向,。
2.2庫中（略）化合物,，均需表標(biāo)明具體（略）來源，如FDA,、EMA,、NMPA等權(quán)威部門審批或收錄在USP、EP,、BP,、JP、CP等藥典文獻(xiàn)中,；庫中的臨床期藥物分子均提供臨床階段與適應(yīng)癥信息。
2.3涵蓋多個研究領(lǐng)域,。腫瘤相關(guān)藥物不低于1100個,、心血管藥物相關(guān)藥物不低于400個、抗炎/免疫相關(guān)藥物不低于600個,、（略）相關(guān)藥物不低于700個,、抗感染相關(guān)分子不低于500個，（略）相關(guān)藥物不低于250個等,。
2.4包括5-HTReceptor,、SodiumChannel,、p38MAPK、PI3K,、MEK等,，（略）不低于30條。
2.5FDA批準(zhǔn)的藥物分子不低于1700個,；處于臨床期的分子不低于3000個,。
2.6不包含無機(jī)鹽、造影劑,、防曬劑等無活性的分子,。
2.7提供詳細(xì)的說明書，包含化合物結(jié)構(gòu),、靶點信息,、適應(yīng)癥信息、活性描述等,。
2.8提供NMR,、HPLC/LCMS等多種檢測技術(shù)，保證產(chǎn)品結(jié)構(gòu)正確,，純度不低于98%,。
2.9超過2000種不同結(jié)構(gòu)類型，具有較好的結(jié)構(gòu)代表性,。后續(xù)具備提供同系列衍生物和類似物的能力,。
2.10提供包裝量不低于1mg粉末。
50
2024年12月
2
“病原微生物靶點及藥物信息庫”網(wǎng)站
為構(gòu)建病原微生物靶點及藥物信息庫需采購“病原微生物靶點及藥物信息庫”網(wǎng)站一套,。
1,、病原微生物靶點庫
1.1能夠展示病原微生物的致病靶點及其三維結(jié)構(gòu)；
1.2通過同源建模的方法構(gòu)建未報道結(jié)構(gòu)的抗病毒關(guān)鍵靶蛋白的三維結(jié)構(gòu),；
1.3確定靶蛋白的活性位點,；
2、藥物信息庫
能夠展示作用于病原微生物靶點的化合物,，包括結(jié)構(gòu)式,、適應(yīng)癥、藥理,、毒理,、相互作用以及藥物的藥效學(xué)、毒理,、藥物吸收,、藥物代謝等數(shù)據(jù)；
3,、（略）頁的查詢界面
實現(xiàn)用戶在單機(jī)上安裝數(shù)據(jù)庫后,，通過web（略）,，進(jìn)行檢索或查詢功能；
4,、藥物篩選
基于分子對接的方法,，預(yù)測小分子與靶蛋白之間的相互作用，進(jìn)行病原微生物靶點的藥物虛擬篩選,；
30
2024年12月
注：1.本次公開的采購意向僅作為供應(yīng)商了解初步采購安排的參考,，采購項目具體情況以最終發(fā)布的采購公告和采購文件為準(zhǔn)；2.供應(yīng)商對本次公示建設(shè)內(nèi)容存在合理化建議,，以及推薦產(chǎn)品或技術(shù)參數(shù)的,，請以電子郵件方式：（略）
聯(lián)系人：（略）
郵箱：（略）
重慶某單位：（略）
2024年11月05日